Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUSC1Q9BVN2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUSC1Q9BVN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms