Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SORCS2Q96PQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms