Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APIPQ96GX9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APIPQ96GX9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms