Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms