Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms