Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASGRP4Q8TDF6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASGRP4Q8TDF6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASGRP4Q8TDF6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms