Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG16L2Q8NAA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms