Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Eda2rQ8BX35 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eda2rQ8BX35 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms