Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCIMPQ6UWF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCIMPQ6UWF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms