Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tlr12Q6QNU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tlr12Q6QNU9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.2 ms