Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE2Q6PIF2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE2Q6PIF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms