Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTC27Q6P3X3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTC27Q6P3X3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms