Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20865Q62460 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20865Q62460 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms