Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh12Q5RJH3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms