Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam208bQ5DTT3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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