Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Otol1Q4ZJM7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Otol1Q4ZJM7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms