Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trip13Q3UA06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip13Q3UA06 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms