Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL38Q2WGJ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms