Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYPL1Q16563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYPL1Q16563 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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