Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM25Q14258 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM25Q14258 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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