Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX2Q13950 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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