Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 GEP4YHR100C 558 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 LSO1YJR005C-A 282 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 NMA1YLR328W 1206 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 MRPL39YML009C 213 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 YML053CYML053C 639 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 FEX1YOR390W 1128 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 FEX2YPL279C 1128 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 UMP1YBR173C 447 nt4.17□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 PUB1YNL016W 1362 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 snR57snR57 88 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 YDR282CYDR282C 1245 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 TYW3YGL050W 822 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 YJL028WYJL028W 336 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 IDP2YLR174W 1239 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 RPS19AYOL121C 435 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 POL31YJR006W 1464 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 MET17YLR303W 1335 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 HCA4YJL033W 2313 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 AIM21YIR003W 2040 nt4.16□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 TAF6YGL112C 1551 nt4.15□□□□□ -1.74
NFI1Q12216 YLR049CYLR049C 1287 nt4.15□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 AIM39YOL053W 1188 nt4.15□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RPG1YBR079C 2895 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 VPS27YNR006W 1869 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 SDT1YGL224C 843 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RSM25YIL093C 795 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 AIM22YJL046W 1230 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 LDB18YLL049W 540 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 SPO19YPL130W 672 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 SCD6YPR129W 1050 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 BIK1YCL029C 1323 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 GAD1YMR250W 1758 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YPK3YBR028C 1578 nt4.14□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 HEF3YNL014W 3135 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RCR2YDR003W 633 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RAI1YGL246C 1164 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 ARC15YIL062C 465 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 NKP2YLR315W 462 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 NIS1YNL078W 1224 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 snR17asnR17a 333 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 PWR1PWR1 941 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 FYV5YCL058C 459 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RAD7YJR052W 1698 nt4.13□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RTS1YOR014W 2274 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 FAR10YLR238W 1437 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 MAG2YLR427W 2013 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 SSH1YBR283C 1473 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YDR056CYDR056C 618 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 FMP10YER182W 735 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 BNA6YFR047C 888 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YAL065CYAL065C 387 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 ELA1YNL230C 1140 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YPL025CYPL025C 558 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 SUA7YPR086W 1038 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 REI1YBR267W 1182 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 CLB5YPR120C 1308 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 AIM14YGL160W 1713 nt4.12□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YDR526CYDR526C 471 nt4.11□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 REE1YJL217W 597 nt4.11□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RUF21RUF21 707 nt4.11□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YIF1YNL263C 945 nt4.11□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 TDA3YHR009C 1572 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 BUD13YGL174W 801 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 HIS6YIL020C 786 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YNL217WYNL217W 981 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 IDH2YOR136W 1110 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 HSP26YBR072W 645 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 PPZ1YML016C 2079 nt4.1□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 LYS2YBR115C 4179 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 REB1YBR049C 2433 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YAR030CYAR030C 342 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RPL18BYNL301C 561 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 RPL18AYOL120C 561 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YPR059CYPR059C 387 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 PRS5YOL061W 1491 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 YMR221CYMR221C 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
NFI1Q12216 MYO3YKL129C 3819 nt4.09□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PRP3YDR473C 1410 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PEX21YGR239C 867 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 ERV29YGR284C 933 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YLF2YHL014C 1218 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PMS1YNL082W 2622 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YNR071CYNR071C 1029 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PSF3YOL146W 585 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 CIN5YOR028C 888 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 DDP1YOR163W 567 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 ISW2YOR304W 3363 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YPL071CYPL071C 471 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 MTC4YBR255W 2085 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PRP22YER013W 3438 nt4.08□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 NUP85YJR042W 2235 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 PEP7YDR323C 1548 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 EMP47YFL048C 1338 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YGL101WYGL101W 648 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 GTF1YGR102C 552 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 BET1YIL004C 429 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 GON7YJL184W 372 nt4.07□□□□□ -1.76
NFI1Q12216 YUH1YJR099W 711 nt4.07□□□□□ -1.76
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