Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCZQ05513 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCZQ05513 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms