Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htr1fQ02284 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Htr1fQ02284 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms