Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crmp1P97427 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Crmp1P97427 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms