Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATN1P54259 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATN1P54259 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATN1P54259 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATN1P54259 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATN1P54259 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATN1P54259 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATN1P54259 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATN1P54259 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATN1P54259 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATN1P54259 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATN1P54259 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms