Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 RIM21YNL294C 1602 nt4.6□□□□□ -1.67
HEF3P53978 CDC45YLR103C 1953 nt4.6□□□□□ -1.67
HEF3P53978 TMN2YDR107C 2019 nt4.6□□□□□ -1.67
HEF3P53978 YHL045WYHL045W 348 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 PRM2YIL037C 1971 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 CDC8YJR057W 651 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 TGL1YKL140W 1647 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 OMA1YKR087C 1038 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 SIR1YKR101W 1965 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 SEO1YAL067C 1782 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 YLR125WYLR125W 411 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 YMR082CYMR082C 357 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 BDP1YNL039W 1785 nt4.59□□□□□ -1.67
HEF3P53978 YPR022CYPR022C 3402 nt4.59□□□□□ -1.68
HEF3P53978 DIP2YLR129W 2832 nt4.59□□□□□ -1.68
HEF3P53978 DIN7YDR263C 1293 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SAY1YGR263C 1275 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 COX19YLL018C-A 297 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 CBP3YPL215W 1008 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 ATG2YNL242W 4779 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR444WYDR444W 2064 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 APE2YKL157W 2859 nt4.58□□□□□ -1.68
HEF3P53978 CUS1YMR240C 1311 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 ABD1YBR236C 1311 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SPR28YDR218C 1272 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR282CYDR282C 1245 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SCL1YGL011C 759 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 AIM26YKL037W 357 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR225CYLR225C 1224 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 BLS1YLR408C 369 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 ECM8YBR076W 1065 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 TRE1YPL176C 2352 nt4.57□□□□□ -1.68
HEF3P53978 PRR2YDL214C 2100 nt4.56□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YGR269WYGR269W 327 nt4.56□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SGN1YIR001C 753 nt4.56□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR049CYLR049C 1287 nt4.56□□□□□ -1.68
HEF3P53978 NAT3YPR131C 588 nt4.56□□□□□ -1.68
HEF3P53978 CNA1YLR433C 1662 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 TRX3YCR083W 384 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 GRX6YDL010W 696 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 NSE3YDR288W 912 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 CUS2YNL286W 858 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 RIB4YOL143C 510 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 JEN1YKL217W 1851 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 STB2YMR053C 2553 nt4.55□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SKM1YOL113W 1968 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 MDM34YGL219C 1380 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 HMG1YML075C 3165 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SSB1YDL229W 1842 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 DOS2YDR068W 933 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 PHO92YDR374C 921 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR391CYDR391C 699 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 GVP36YIL041W 981 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 GMH1YKR030W 822 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 TGL4YKR089C 2733 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 SPT10YJL127C 1923 nt4.54□□□□□ -1.68
HEF3P53978 PPZ1YML016C 2079 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YJR026WYJR026W 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YJR028WYJR028W 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YAR010CYAR010C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YML040WYML040W 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YMR051CYMR051C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 TCM62YBR044C 1719 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 FAD1YDL045C 921 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YDL124WYDL124W 939 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 DAM1YGR113W 1032 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 TIF34YMR146C 1044 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 GLO4YOR040W 858 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 RPS9BYBR189W 588 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 CHD1YER164W 4407 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 RRN6YBL014C 2685 nt4.53□□□□□ -1.68
HEF3P53978 RNY1YPL123C 1305 nt4.52□□□□□ -1.69
HEF3P53978 COS7YDL248W 1152 nt4.52□□□□□ -1.69
HEF3P53978 LSM12YHR121W 564 nt4.52□□□□□ -1.69
HEF3P53978 COS5YJR161C 1152 nt4.52□□□□□ -1.69
HEF3P53978 EMG1YLR186W 759 nt4.52□□□□□ -1.69
HEF3P53978 HUL4YJR036C 2679 nt4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms