Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
SMARCA2P51531 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SMARCA2P51531 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
SMARCA2P51531 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
SMARCA2P51531 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms