Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POU3F4P49335 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU3F4P49335 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms