Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDFT1P37268 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FDFT1P37268 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms