Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 TEF4YKL081W 1239 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 MTD1YKR080W 963 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 NSE1YLR007W 1011 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 POL12YBL035C 2118 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YPR142CYPR142C 564 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 NNK1YKL171W 2787 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 GAS4YOL132W 1416 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 CDC4YFL009W 2340 nt5.22□□□□□ -1.57
APL2P36000 ALG1YBR110W 1350 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 TYW1YPL207W 2433 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 SDT1YGL224C 843 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 LOH1YJL038C 660 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 CMC1YKL137W 336 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 SMD3YLR147C 306 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 GAB1YLR459W 1185 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 URA5YML106W 681 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 YMR315WYMR315W 1050 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 YBL094CYBL094C 333 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.21□□□□□ -1.58
APL2P36000 YMR1YJR110W 2067 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 CPR1YDR155C 489 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 PLP1YDR183W 693 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 SUR2YDR297W 1050 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 KXD1YGL079W 657 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 MRPS35YGR165W 1038 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 MIC26YGR235C 702 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 CYC1YJR048W 330 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 SRL4YPL033C 846 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 YBR219CYBR219C 384 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 KEX1YGL203C 2190 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 IME4YGL192W 1803 nt5.2□□□□□ -1.58
APL2P36000 DAL81YIR023W 2913 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 YDL186WYDL186W 834 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 FBP1YLR377C 1047 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 SPC2YML055W 537 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 MDJ2YNL328C 441 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 IZH4YOL101C 939 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 SET6YPL165C 1122 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 YPR027CYPR027C 834 nt5.19□□□□□ -1.58
APL2P36000 ADP1YCR011C 3150 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YKR015CYKR015C 1707 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 FLC1YPL221W 2382 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YGL152CYGL152C 678 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 SNL1YIL016W 480 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 TTI2YJR136C 1266 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YLR156WYLR156W 345 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YLR159WYLR159W 345 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 YLR161WYLR161W 345 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 SNF8YPL002C 702 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 PBP2YBR233W 1242 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 BUD8YLR353W 1812 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 MPS3YJL019W 2049 nt5.18□□□□□ -1.58
APL2P36000 SBE2YDR351W 2595 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 LYS2YBR115C 4179 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 YGR015CYGR015C 987 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 SPO11YHL022C 1197 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 PER33YLR064W 822 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 VPS20YMR077C 666 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 YBR013CYBR013C 390 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 GRX5YPL059W 453 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 BSD2YBR290W 966 nt5.17□□□□□ -1.58
APL2P36000 ABF1YKL112W 2196 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YCR015CYCR015C 954 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 DAS2YDR020C 699 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YGR079WYGR079W 1113 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YGR269WYGR269W 327 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YKE4YIL023C 1041 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 UTP11YKL099C 753 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YLR407WYLR407W 687 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 YNL171CYNL171C 369 nt5.16□□□□□ -1.58
APL2P36000 MED7YOL135C 669 nt5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms