Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd28P31041 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd28P31041 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms