Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRDP23468 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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