Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn1s1P19228 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms