Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl1P12850 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms