Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP2O75044 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms