Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VEGFDO43915 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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