Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ2O43526 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ2O43526 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ2O43526 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ2O43526 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ2O43526 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNQ2O43526 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ2O43526 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms