Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx1aO35526 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1aO35526 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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