Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN2DO15399 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN2DO15399 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms