Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rundc3aO08576 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rundc3aO08576 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc3aO08576 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms