Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms