Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRDCB7Z8K6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms