Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60cB1B213 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H60cB1B213 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H60cB1B213 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms