Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms