Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srd5a3Q9WUP4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srd5a3Q9WUP4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srd5a3Q9WUP4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms