Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TTF2Q9UNY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTF2Q9UNY4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms