Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MKLN1Q9UL63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms