Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD4Q9NVD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD4Q9NVD3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms