Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A4GALTQ9NPC4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A4GALTQ9NPC4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms